Сюжет игры крутится вокруг фэл’Си — расы, существовавшей ещё до возникновения человечества. Люди, отмеченные фэл’Си ради высших целей, носили имя л’Си. Около тринадцати веков назад мистический Кристалл приказал фэл’Си сотворить рай для людей. Был построен город в виде раковины под названием Кокон, который до сих пор витает в воздухе над поверхностью мира Пульс, в котором после этого появился собственный Кристалл. Кристалл Кокона создал жизнь и машины для своих жителей, и народ начал процветать. Со временем люди Кокона начали бояться за свой мир, бояться, что он может упасть с неба. В настоящее время глуши Пульса отрицательно влияют на людей и Святое Правительство Кокона приняло решение изолировать всех людей, попавших под это влияние. Женщина с кодовым именем Молния стала той избранной Кристалла, которая должна стать врагом человечества и положить конец Кокону.

Кокон – своего рода небесная утопия, несбывшийся рай его граждан и обитателей. Жители города боготворили это райское место, они, как в коконе, могли укрыться от проблем человечества и вселенского хаоса только здесь. В то время, как Коконом управлял Священный союз (Sanctum), то город процветал и утопал в благополучии. Жители Кокона думали, что никогда не испытают того, что предстояло испытать. Могучие фал’Си (fal’Cie) охраняли людей, защизали их настолько, насколько могли. Но злобный фал’Си Бартенделус изменил всё. Этот фал’Си проснулся от длительного сна на планете Гран Пульс, Обладая существенной властью и уважением, он смог убедить фал’Си, что люди – это всего лишь инкубатор для них, люди – бездушные, ни на что не годные паразиты, которых нужно уничтожать. Фал’Си прокляли людей и превратили их в своих рабов, наделив магическими способностями. Теперь люди должны были исполнять опаснейшие миссии для фал’Си. Люди стали избранными фал’Си и их стали называть л’Си. Те люди, которых заклеймили фал’Си, должны были выполнить свою Задачу, свою МиссиЮ, благодаря которой их ждёт прощение. Те же, кто не справится с Задачей – будут мучатся вечно и их постигнет судьба страшнее самой смерти.

P.s Все главные герои по сюжету Л’Си.
Остальная информация.